Sequencing the Black Rhino Genome kan de soort redden van uitsterven

$config[ads_kvadrat] not found

What's The Difference Between White Rhino And Black Rhino? | Love Nature

What's The Difference Between White Rhino And Black Rhino? | Love Nature
Anonim

De 21ste eeuw is een fantastische tijd om een ​​bio-ingenieur te zijn en een vreselijke tijd om een ​​zwarte neushoorn te zijn. De Afrikaanse soort, die 850.000 een eeuw geleden telde, is geslonken tot een snel afnemende bevolking van ongeveer 5.000. In de hoop op een dag terugspoelen van deze catastrofale achteruitgang, proberen biologen de sequencing van de diceros bicornis bicornis genoom.

Het project is een gezamenlijke inspanning van verschillende biotech-experts op het gebied van milieubescherming, waaronder patholoog en bio-ingenieur van de Universiteit van Washington, Dr. Charles Murray en Matthew Markus, de CEO van Pembient. Pembient is een biotechnologiebedrijf uit San Francisco dat de Chinese markten wil overspoelen met synthetische - maar biologisch identieke - neushoornhoorn, 3D geprint uit keratine op laboratoriumschaal en misschien afgeleverd als neushoornbier. (Keratine is het spul waar je vingernagels en neushoornhoorns van gemaakt zijn. Het is niet magisch of medicinaal.) Pembient kon genoeg leren van het genoom van een enkele neushoorn genaamd Ntombi, vertelde Markus omgekeerde, om de manier waarop het neushoornproteïnen synthetiseert te verfijnen.

Maar voordat iemand de genetica van Ntombi voor gegevens kan ontginnen, moet eerst het genus van de zwarte neushoorn worden gesequenced. Het project is ongeveer halverwege met het inzamelen van $ 16.500 op Experiment.com, een crowdfundingplatform zoals Kickstarter, met uitzondering van de wetenschap in plaats van het herrijzen van lang geleden verdwenen videogames.

"Er zijn nog steeds relatief weinig organismen waarvan de genomen zijn gesequenced", zegt Murray. "Tot voor kort was dit erg moeilijk - tijdrovend en duur."

Dat wil niet zeggen dat dieren hun genomen niet af krijgen. Het Genome 10K-project beoogt de verzameling genetische gegevens van een Noah te verzamelen. En de zuidelijke witte neushoorn, een meer dichtbevolkte en grotere soort, liet zijn genoom in 2012 sequeneren. Maar hoe zit het met zwarte neushoorns zoals Ntombi? "Het is niet duidelijk waarom de zwarte neushoorn zo lang opzij is gebleven", zegt Markus. Hij tekent de weglating tot aan het toeval; maar het kan zijn dat, omdat de zuidelijke blanken al een sequentie hadden, de zwarte neushoorn geen prioriteit was.

Markus, Murray en hun medewerkers willen die kloof dichten. Ntombi, de neushoorn voor het project, heeft al bloed laten strijken en bewaren - en bingo! Rhino DNA. De volgorde moet redelijk eenvoudig zijn, zei Murray. "Het is een grote hulp om het witte-neushoorngenoom als benchmark te gebruiken."

De volgende stappen in de reeks

Met Ntombi's DNA gehost op de servers van DNAnexsus, hebben de biologen de basis gelegd voor vergelijkende neushoornenomica. "Zodra we haar volgorde hebben gekregen, kunnen we beginnen te begrijpen wat een neushoorn tot neushoorn maakt, hoe het wit verschilt van het zwart," zegt Murray, "en informatie verschaffen die gepocheerde monsters kan volgen."

Dierenartsen kunnen controleren op mogelijk ziekteverwekkende genen en hebben een baseline om de andere zeven ondersoorten van de zwarte neushoorn te vergelijken - waarvan er drie al zijn uitgestorven.

De dieren na morgen

Zodra we een beter begrip hebben van de genen van de zwarte neushoorn, openen verschillende theoretische deuren. "Onderweg ben ik enthousiast over het gebruik van stamcellen om de neushoornfysiologie te begrijpen en, mogelijk, om neushoornhoorns in het laboratorium te laten groeien om stroperij te verminderen," zegt Murray.

Markus prognosticeert een beetje verder. Voor diceros bicornis bicornis, Markus ziet niet zoveel mammoetachtige de-extinctie voor ogen, maar keert terug naar de genetische klok; hoe kleiner de populaties worden, hoe gevoeliger ze zijn voor geërfde problemen.

En voor de zwarte neushoorns die weg zijn? Hij vergelijkt deze inspanning met die van het sequencen van het noordelijke witte neushoorngenoom, een project dat loopt in de dierentuin van San Diego. Er is sprake van proberen een witte neushoorn te krijgen (waarvan er 20.000 zijn) om een ​​noordelijke witte neushoorn te dragen (waarvan er 5 zijn). Markus spreekt met voorzichtig, voorzichtig optimisme: "Potentieel - mogelijk - misschien kan de uitgestorven zwarte neushoornsoorten opnieuw tot leven worden gewekt."

$config[ads_kvadrat] not found