Gamers die 'EteRNA' spelen, verslaan gewoon professionele wetenschap tot deze cruciale ontdekking

$config[ads_kvadrat] not found

10 Gamers Who Tragically Died Playing Videogames

10 Gamers Who Tragically Died Playing Videogames
Anonim

Burgerwetenschap ging net het volgende niveau: videogamers hebben een biologische ontdekking gedaan en het is nu gepubliceerd door een door collega's beoordeeld wetenschappelijk tijdschrift.

Gepubliceerd deze week in de Journal of Molecular Biology, een reeks intuïtief ontwikkelde regels voor hoe moeilijk een bepaalde vorm zal zijn om te bereiken door middel van RNA-ontwerp. Ze vonden bijvoorbeeld dat hoe symmetrischer een vorm is, hoe moeilijker het zal zijn om een ​​RNA-streng te ontwerpen die daarmee overeenkomt.

Het collectief van video-gamers maakte de ontdekking door te spelen, Eterna, een spel dat spelers uitdaagt om strengen RNA te nemen en deze in een gewenste vorm te vouwen door hun chemische samenstelling te veranderen. Het wetenschappelijke probleem van het vouwen van RNA in een bepaalde vorm is complex, maar het spel is niet - geen begrip van biochemie is vereist om te beginnen met spelen.

De gamers namen de onderzoeksvraag op eigen initiatief op, als een manier om nieuwere spelers tools te geven om de relatieve moeilijkheid van verschillende puzzels te beoordelen. De bevindingen zullen helpen bij het begeleiden van toekomstig biomedisch onderzoek, omdat de nieuwe set regels wetenschappers een beter idee geeft van het al dan niet proberen om RNA in een bepaalde vorm te vouwen, is een zinloze oefening.

"Dit onderzoek suggereert dat het standaardparadigma van wetenschappelijke crowdsourcing kan worden omgedraaid", vertelt Rhiju Das, professor biochemie aan Stanford, omgekeerde in een e-mail. Eterna werd gelanceerd in 2011 door Das en Adrien Treuille, een assistent-professor in de computerwetenschappen aan de Carnegie Mellon University. “ Eterna spelers kunnen hun eigen onderzoeksvragen bedenken en kunnen hun eigen papieren schrijven. In dit onderzoek was er een beetje begeleiding en onafhankelijke testen van experts in mijn laboratorium."

Gesynthetiseerd RNA heeft een ongelooflijk potentieel voor een nieuwe generatie medicijnen en medische therapieën. Als het in de juiste vorm kan worden gevouwen, kan RNA worden gemaakt om specifieke virussen, kankers en zelfs genetische aandoeningen te bestrijden. CRISPR, een proces voor het bewerken van genen dat de toekomst van het menselijk bestaan ​​drastisch zou kunnen veranderen, gebruikt RNA om het DNA-snijdende enzym, Cas9, naar het ongewenste deel van het DNA te leiden.

Eterna begon als een forum voor deskundige wetenschappers om puzzels te presenteren aan de gamers, maar het is sindsdien verder gegroeid. Het spel en zijn 100.000 geregistreerde spelers bestaan ​​nu in een symbiotische en evoluerende relatie met professionele wetenschappers en computermodellen die zijn gebouwd om de RNA-structuur te ontwerpen en te testen.

"Computermodellen en Eterna zijn niet exclusief, "zegt Das. “ Eterna brengt veel mensen bij elkaar, van wie sommigen hun eigen computermodellen schrijven."

In het huidige artikel schreven de spelers samen scripts om hun ideeën te testen voor wat het moeilijk maakt om RNA-structuren te ontwerpen. Das zegt dat sommige spelers hem vertelden dat ze erg enthousiast zijn om hun ideeën te automatiseren in computermodellen omdat ze door willen gaan om meer lastige problemen op te lossen.

Problemen gebouwd door Eterna spelers worden daadwerkelijk gesynthetiseerd in Das 'lab - tot nu toe zijn er 86.459 door spelers gegenereerde sequenties IRL gebouwd.

De hoofdauteurs van het artikel waren Eterna gamers Jeff Anderson-Lee, Eli Fisker, Vineet Kosaraju en Michelle Wu. Wu is ook een Ph.D. student in biomedische informatica op Stanford.

In de toekomst zou het kunnen dat burgerdeskundigen beginnen met het volledig onafhankelijk publiceren van wetenschappelijke ontdekkingen.

"Deze 'flipped crowdsourcing'-template voor burgerwetenschap kan nuttig zijn voor andere projecten en wetenschapsgebieden, zoals astronomie (Galaxy Zoo) of identificatie van personen (identificatie van soorten) Barcode van het leven), "Zegt Das. "Vooral als ze, zoals Eterna, zien we knelpunten in het stadium van het schrijven van papier."

$config[ads_kvadrat] not found